畸形精子是否会自然恢复，需要根据引起的原因进行综合判断。如果是不良生活习惯引起的，一般会自然恢复；如果是由精索静脉曲张、睾丸炎等疾病因素引起的，则不会自然恢复。

一、会自然恢复

1.不良生活习惯：如果患者长期吸烟酗酒或者经常食用辛辣刺激的食物，可能会导致体内的雄激素水平下降，从而影响到精子的质量。建议患者要养成良好的生活习惯，避免熬夜，戒烟戒酒，并且要注意饮食清淡，多吃新鲜的水果蔬菜以及高蛋白类食物，有助于改善症状。

二、不会自然恢复

2.精索静脉曲张：精索静脉曲张是指由于包绕精索的精索静脉和蔓状静脉丛的瓣膜功能障碍，血液倒流，回流入左肾静脉或直肠静脉。可表现为阴囊肿大、隐痛不适等症状。如果不及时治疗，可能会影响生育能力。对于轻度精索静脉曲张，可以采取药物治疗，如迈之灵片、地奥司明片等。重度精索静脉曲张可行手术治疗，如腹腔镜下精索静脉高位结扎术。

3.睾丸炎：睾丸炎是细菌感染所引起的一种炎症反应，会导致局部出现红肿热痛的情况，严重时还会诱发死精症，从而影响正常的生育能力。此时可以在医生指导下服用抗生素类药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊等，能够起到抗感染的作用，有利于病情的恢复。

除此之外，还可能是附睾炎等原因引起的，建议应及时前往医院就医检查，在医生的指导下对症治疗。