生化妊娠是指受精卵没有着床，即在临床上看不到妊娠的征兆，而血或尿中HCG值又未升高。疏通输卵管后生化两次，可能与胚胎质量不佳、子宫内膜过薄、免疫因素、男方精子质量差等因素有关。

1、胚胎质量不佳：如果胚胎染色体异常，或者存在其他问题，可能会导致生化妊娠。此时建议夫妻双方进行检查，如染色体检查等，明确原因后可遵医嘱选择合适的方案备孕；

2、子宫内膜过薄：如果女性子宫内膜过薄，则会影响受精卵着床，从而出现生化妊娠的情况。建议女性遵医嘱服用戊酸雌二醇片、黄体酮胶囊等药物进行治疗，可以促进子宫内膜增厚，在一定程度上有利于受精卵着床；

3、免疫因素：如果女性自身存在抗精子抗体、抗子宫内膜抗体等免疫因素，则会影响受精卵着床，从而出现生化妊娠的情况。建议女性遵医嘱服用醋酸泼尼松片、地塞米松片等药物进行治疗，必要时也可以通过试管婴儿的方式进行辅助生育；

4、男方精子质量差：如果男性精子质量较差，则会导致精子畸形率增加，从而影响受精卵着床，导致生化妊娠。建议男性遵医嘱服用维生素E软胶囊、维生素C片等药物进行调理，并且注意避免吸烟喝酒。

此外，如果女性年龄较大，则可能会出现卵巢功能衰退的情况，也会影响受精卵着床，导致生化妊娠。建议女性及时到医院就诊，在医生指导下根据具体情况进行处理。