法莫替丁和奥美拉唑的区别，主要在于药物作用机制不同、药理作用不同、适应证不同以及不良反应不同等。

1.药物作用机制不同：法莫替丁属于H2受体阻滞剂，能够抑制胃酸分泌。而奥美拉唑是一种质子泵抑制剂，可以起到抑制胃酸的作用。

2.药理作用不同：法莫替丁具有抗酸保护胃黏膜的功效，在临床上主要用于治疗消化性溃疡、应激性溃疡及反流性食管炎等疾病引起的不适症状。而奥美拉唑则具有抑制胃酸分泌的功效，在临床上主要用于治疗十二指肠溃疡、胃溃疡、反流性食管炎等疾病的患者。

3.适应证不同：法莫替丁适用于因胃酸过多引起的各种不适症状的患者。而奥美拉唑除了用于上述情况外，还可用于治疗急性胃黏膜病变、上消化道出血等情况。

4.不良反应不同：部分患者在服用法莫替丁后可能会出现恶心、呕吐、腹泻等症状。而部分患者在服用奥美拉唑后会出现腹胀、便秘、头痛、嗜睡等不良反应。

建议患者需要在医生指导下进行用药治疗，避免自行使用，以免诱发不良反应，损害身体健康。如果患者服药期间出现明显不适，应及时就医诊治。