甲基化检测和HPV检测的主要区别在于检测项目不同、检测原理不同、检测试剂不同，以及检测的意义不同。如果无法自行判断，建议及时就诊，明确具体的原因。

1、检测项目不同：甲基化检测是通过基因测序的方式，检测基因是否存在缺陷，并不能确定患者是否患有疾病。而HPV是通过病毒抗体的方式检测患者是否存在病毒感染，因此两者的检测项目不同;

2、检测原理不同：甲基化检测是通过基因测序的方式，在基因中加入甲基化的试剂，并对其进行一定时间的扩增，然后再进行检测，如果某一段位点发生了甲基化，就可以判断患者是否存在基因缺陷。HPV是通过病毒抗体的方式进行检测，可以判断患者是否存在病毒感染，也可以判断患者是否存在尖锐湿疣、扁平疣、宫颈癌等疾病;

3、检测试剂不同：甲基化检测试剂属于第三代试剂，是通过蛋白质中的氨基酸残基发生人工合成，并通过显微注射的方式得到氨基酸，进而判断患者是否存在氨基酸缺陷。HPV抗体分为二价抗体、四价抗体和九价抗体，如果患者感染了HPV病毒，则可以通过二价抗体进行检测，如果是四价抗体，则可以判断患者是否感染HPV病毒，九价抗体则可以判断患者是否感染HPV病毒;

4、意义不同：甲基化检测只能判断患者是否存在基因缺陷，通常不能判断患者是否为HPV病毒的携带者。HPV除了可以判断患者是否存在HPV病毒感染外，还可以判断患者是否存在尖锐湿疣、扁平疣、宫颈癌等疾病。

如果想要进行甲基化和HPV检查，建议及时到医院的妇科就诊，在医生的指导下进行此类检查。