孕妇孕酮低是否会胎儿畸形，需要根据具体情况进行判断。如果孕妇出现孕酮偏低的情况，并且没有其他不适症状，则一般不会导致胎儿畸形；但如果孕妇出现明显的不适症状，则可能会导致胎儿畸形。

1.不会：如果孕妇在怀孕期间出现了轻微的孕酮偏低情况，但是并没有伴随腹部疼痛、阴道出血等不良反应，一般是不需要过分担心的，也不用进行特殊治疗。建议患者多卧床休息，避免做剧烈运动，还要注意饮食健康，多吃富含雌激素的食物，比如豆腐、豆浆等，从而为身体补充所需要的营养物质，在一定程度上也可以缓解病情。

2.会：如果孕妇体内的孕酮水平持续下降，并且伴有腹痛、阴道流血等症状，可能是先兆流产引起的，此时则会导致胎儿畸形。建议孕妇及时到正规医院通过B超检查、抽血化验等方式明确病因后就诊治疗，以免延误病情。

日常生活中，建议孕妇定期去医院进行产检，了解胎儿的身体发育情况。同时也要保持良好的心态，不要过度紧张和焦虑，以免影响胎儿的生长发育。