精子畸形率高是否难治，需要根据引起的原因进行综合考虑。如果是不良生活习惯引起的，并不难治疗。如果是生殖系统感染、精索静脉曲张等原因导致的，则比较难治疗。

1.并不难治疗：如果在日常生活中长期吸烟酗酒或经常处于高温环境当中，可能会使体内的精子受到损伤，从而出现精子畸形的情况。此时患者可以通过改变生活方式的方式进行缓解，在平时要戒烟戒酒，避免长时间处于高温环境中。同时还要注意多休息，保证充足的睡眠时间，养成良好的作息习惯。经过积极有效的治疗后，一般是可以治愈的。

2.比较难治疗：但如果存在生殖系统感染或者是精索静脉曲张等方面的疾病，可能会影响到正常的生育能力，甚至还会伴有局部疼痛等现象。此时属于一种慢性病，通过自身的免疫力是无法彻底清除病毒的，所以是比较难治疗的。

建议患者及时到正规医院的男科，通过阴囊彩超检查、血常规检查等方式明确病因后就诊治疗。