做完肛瘘手术后疼痛的时间，需要根据患者的实际情况进行判断。肛瘘是指连接肛管周围的肉芽肿性管道，大部分由直肠肛管周围脓肿引起，表现为肛周反复破溃、流脓、疼痛等症状。

一、疼痛时间较短：

如果患者术后创面清洁卫生较好，没有出现感染的情况，一般疼痛3-5天后会逐渐缓解。如果患者的肛瘘属于复杂性肛瘘，由于瘘管较多而且位置深，手术时造成的创面较大，并且伤口愈合缓慢，因此患者疼痛时间可能会比较长，可超过7天。

二、疼痛时间较长：

1、术后感染：如果术后患者不注意清洁卫生，造成伤口感染，出现肛周脓肿，可能会加重疼痛症状，疼痛时间也会延长，甚至持续1-2周;

2、术后愈合困难：如果患者属于高位复杂性肛瘘，由于瘘管位置较高，手术时造成的创面较大，并且伤口愈合缓慢，因此患者疼痛时间较久，可超过1个月;

3、术后疤痕增生：如果患者属于瘢痕体质，术后切口部位形成瘢痕增生，可能会引起局部刺激，造成疼痛时间延长;

4、局部水肿：术后如果局部引流不畅，或者局部出现感染，可能会导致水肿加重，从而持续加重疼痛症状。

患者做完肛瘘手术后要注意休息，避免剧烈活动，按时换药。同时建议多吃含纤维素高的食物，保持大便通畅，以免便秘对肛门造成刺激。另外，还需注意肛门卫生，排便后可用温水清洗局部，减少感染的发生。