男人小便刺痛，且伴有腰疼、发烧，可能是泌尿系统感染、前列腺炎、肾结石、肾结核导致。建议患者及时到医院就诊，根据病因进行相应的治疗。

1、泌尿系统感染：如尿道炎、肾盂肾炎等，通常是病原体感染尿路引起，由于炎症刺激可以导致男人出现小便刺痛，且伴有发烧等全身症状。此时建议多饮水、多排尿，配合口服抗生素治疗，如头孢地尼胶囊、盐酸左氧氟沙星片等;

2、前列腺炎：如果男人性生活不规律或长期手淫等，可能导致前列腺炎，由于炎症刺激可以造成小便刺痛，且伴有腰疼、发烧等症状。此时需要口服前列舒通胶囊、左氧氟沙星片等药物治疗，同时应避免过度手淫;

3、肾结石：通常继发于肾盂肾炎、输尿管狭窄等，由于结石对尿路黏膜造成刺激，可以导致男人出现小便刺痛，且伴有腰疼、发烧等症状。如果结石较小，可以通过多饮水促进结石排出。如果结石较大，则需要通过手术将结石取出;

4、肾结核：肾结核早期会出现脓尿，晚期会出现血尿，由于炎症刺激可以导致男人出现小便刺痛，且伴有腰疼、发烧等全身症状。此时需要口服抗结核药物治疗，如异烟肼片、利福平胶囊等;

5、其他原因：男人服用某些药物，如抗生素类药物，可能会出现小便刺痛，且伴有腰疼、发烧等症状。此时多喝水促进药物代谢即可，必要时可以口服布洛芬缓释胶囊进行缓解。