长时间吃药大便发黑，可能是铁元素摄入过多、胃溃疡、胃炎或胃癌等原因导致。具体的治疗方法要根据病理类型来决定，建议患者及时前往医院进行相关检查，在医生指导下进行治疗。

1、铁元素摄入过多：如果患者在服药期间进食了动物肝脏、海带等含铁元素较多的食物，且同时进食了深颜色的食物，可能会导致长时间吃药大便发黑的现象。此时，无需进行特殊治疗，停止吃药、改善饮食后症状会逐渐缓解;

2、胃溃疡：长时间吃药可能会刺激胃黏膜，引起胃黏膜损伤，从而导致胃溃疡。如果出血量不多，且血液在胃内存留时间较长，可能会出现长时间吃药大便发黑的现象。患者可以在医生指导下，服用奥美拉唑肠溶胶囊或铝碳酸镁咀嚼片等药物进行治疗;

3、胃炎：长时间吃药可能会损伤胃黏膜，从而导致胃炎。如果患者饮食不当，则容易诱发胃炎，使炎症加重造成消化道出血，血液在肠道内停留时间长就会出现大便发黑的现象。患者可以在医生指导下，服用泮托拉唑钠肠溶片或奥美拉唑肠溶胶囊等药物进行治疗;

4、胃癌：长时间吃药可能会使胃部出现不典型增生，从而增加胃癌的风险。癌细胞生长过程中可能会侵犯血管，使血管发生破裂出血，血液和粪便混合后，可能会出现长时间吃药大便发黑的现象。建议患者及时进行手术切除肿瘤治疗，并采取放疗或化疗等方式辅助治疗。

引起长时间吃药大便发黑的原因较多，建议患者平时清淡饮食、多吃水果蔬菜或高蛋白类食物，少吃辛辣刺激性食物。