做完肛瘘手术有可能复发，做肛瘘手术只能使肛瘘得到暂时的治疗，而不能使肛瘘不再复发。肛瘘是由于肛管直肠周围的脓肿，或者其他感染性疾病波及而引起的病变，肛瘘有原发性和继发性两种，可以部分通过血液或者淋巴系统等引起局部的感染，而形成新的肛瘘。

一、原发性肛瘘：

1、切开瘘管：手术是将瘘管切开或切除，形成开放的创面利于愈合，但是由于肛瘘的主要是由内口、瘘管和外口三部分组成，有时内口也可以引起肛门周围的感染，所以切开内口后，可以使局部引流通畅，是治疗肛瘘的主要方法;

2、挂线疗法：适用于低位单纯性的低位肛瘘，术后患者可以不需要进行其他特殊处理，定期进行消毒换药即可;

3、肛瘘切除术：是将瘘管全部切开或者切除，将内口、瘘管和外口三部分完全切除，由于是在直肠内进行手术，所以术后有可能会引起肛瘘复发。

二、继发性肛瘘：

1、肛周脓肿：是指位于肛门周围皮下间隙内的脓肿，大多继发于肛腺感染。肛周脓肿自行破溃或切开引流后可形成肛瘘，所以手术是治疗肛瘘的主要方法，但当肛周脓肿未完全愈合时，也可能会导致肛瘘复发;

2、克罗恩病：克罗恩病是一种病因不明的胃肠道慢性炎性肉芽肿性疾病，患者会出现腹痛、腹泻、血便等症状。如果行手术治疗并切除病变组织，有可能导致肛瘘复发;

3、结核性腹膜炎：患者患有结核性腹膜炎时，会导致腹膜和腹腔的慢性炎症蔓延，波及到肠道时会导致肠壁增厚，形成肠腔溃疡，如果病情迁延不愈，则有可能导致肛瘘复发;

4、其他原因：如肛周皮肤化脓性感染破溃后形成的脓肿，或者克罗恩病引起的肉芽肿性疾病等，均可导致肛瘘复发。