枯草杆菌二联活菌颗粒副作用一般有腹泻、皮疹等，患者需要在医生指导下用药。

1.腹泻：枯草杆菌二联活菌颗粒是一种微生态制剂，主要成分是活菌冻干粉、短链低聚果糖。如果患者服用药物不当或者过量服用，可能会对胃肠道造成刺激，从而出现腹痛、腹泻等症状。建议患者及时停药，并遵医嘱服用蒙脱石散、复方黄连素片等药物进行治疗。

2.皮疹：部分患者服用枯草杆菌二联活菌颗粒后会出现过敏反应，导致皮肤上出现红斑、丘疹等皮疹症状。此时需立即停止使用该药物，并且可以在医生的指导下口服氯雷他定片、盐酸西替利嗪胶囊等抗组胺类药物进行治疗。

除此之外，还可能引起恶心呕吐、食欲不振等不良反应。若服药期间身体不适，应及时就医诊治。