生理期出现卵巢囊肿，导致不孕不育有多种原因，如子宫内膜异位症、巧克力囊肿、畸胎瘤、卵巢癌，患者需明确病因后进行针对性治疗。

1、子宫内膜异位症：子宫内膜异位症可能导致患者出现不孕不育，因为子宫内膜异位症可能会造成输卵管粘连，导致输卵管的蠕动功能减弱，影响卵子的排出，而且子宫内膜异位症也会出现盆腔粘连，导致输卵管的堵塞，从而影响精子和卵子结合，甚至影响受精卵的着床，从而导致患者不孕不育。建议患者进行腹腔镜手术，松解粘连，切除病灶，恢复输卵管的正常功能，从而提高妊娠率;

2、巧克力囊肿：巧克力囊肿有可能会影响患者的卵巢功能，进而导致排卵障碍，或者影响子宫内膜的正常状态，干扰受精卵的着床，从而导致患者不孕不育。建议巧克力囊肿的患者尽早通过手术切除囊肿，如果术后没有生育要求，可以考虑上环，或者口服避孕药进行治疗;

3、畸胎瘤：畸胎瘤有可能会影响患者的卵巢功能，从而导致排卵异常或者影响子宫内膜的状态，导致患者不孕不育。建议患者尽早进行手术切除畸胎瘤，如果术后没有生育要求，可以考虑放弃妊娠;

4、卵巢癌：卵巢癌可能会影响患者的卵巢功能，进而导致患者出现不孕不育。因为癌细胞可能破坏卵巢的组织，影响卵子的质量，从而导致患者不孕不育。建议患者尽早进行手术切除治疗，术后根据病理情况进行化疗、放疗等。

生理期发现有囊肿的女性建议及时就诊，在医生的指导下进行治疗。同时需要注意情绪稳定，避免焦虑、紧张等不良情绪。