孕40天孕酮低出血，可能是先兆流产、宫外孕等非病理性因素导致的，也有可能是宫颈炎、子宫内膜息肉等病理原因引起的。

一、生理性因素

1.先兆流产：如果孕妇在怀孕期间受到外界刺激或者胚胎染色体异常等原因，可能会出现阴道少量流血的情况。建议患者及时到正规医院就诊，并且遵医嘱服用黄体酮胶囊进行保胎治疗。

2.宫外孕：是指受精卵着床于输卵管部位，随着胎儿增大而逐渐破裂的一种疾病。由于体内激素水平发生变化，所以会出现腹部疼痛以及阴道不规则出血等症状。此时需要通过手术的方式将妊娠囊切除，从而达到治愈的目的。

二、病理性因素

1.宫颈炎：通常是因病原微生物感染所引起的一种炎症反应，通常会伴随阴道分泌物增多、阴道异常出血等情况发生。可配合医生使用阿奇霉素分散片、盐酸多西环素片等药物进行抗感染治疗。

2.子宫内膜息肉：是一种常见的妇科良性病变，发病机制尚不清楚，可能与雌激素水平过高有关。主要表现为月经量过多、经间期出血或接触性出血等症状。对于症状较轻者，一般不需要特殊处理，定期复查即可；而对于症状严重者，则需采取宫腔镜下息肉摘除术等方式进行治疗。

除此之外，还可能是盆腔炎、子宫肌瘤等疾病造成的，也会出现上述情况。