口腔内侧长透明小水泡考虑是饮食不当、过敏、病毒感染、黏液腺囊肿等原因导致，建议及时明确诊断后，在医生指导下进行治疗，以免贻误病情。

1、饮食不当：口腔内侧长透明小水泡可能是由于吃辛辣刺激性食物导致，辛辣刺激性食物会刺激口腔内部的黏膜，造成黏膜组织损伤，从而出现透明小水泡的症状，一般不需要特殊治疗，饮食上避免吃辛辣、刺激性食物，多吃蔬菜、水果可逐渐缓解。

2、过敏：口腔内侧长透明小水泡可能是由于过敏导致，当患者接触到过敏原时，会导致机体释放炎症因子，炎症因子会刺激口腔内部的黏膜，导致口腔内侧长透明小水泡，患者可在医生的指导下使用盐酸左西替利嗪片、氯雷他定片等药物进行治疗。

3、病毒感染：比如疱疹病毒，患者可能是由于接触了疱疹病毒导致感染，疱疹病毒会在口腔内侧长出疱疹，伴有疼痛感，患者可在医生的指导下使用盐酸伐昔洛韦片、普瑞巴林胶囊等药物进行治疗。

4、黏液腺囊肿：黏液腺囊肿是常见的唾液腺瘤样病变，主要是由于局部创伤导致唾液腺导管破裂或阻塞引起，由于局部黏液腺堵塞，腺体内的分泌物潴留，会导致局部出现透明小水泡，患者可在医生的指导下进行手术治疗。

除以上情况外，还可能是唇炎、口腔疱疹、口腔癌导致，患者可及时去医院口腔科就诊，完善组织病理学检查、细胞学检查、唾液检测等明确具体原因，然后遵医嘱进行治疗。