经颅磁刺激是通过磁刺激大脑皮层，调节神经递质释放，在一定程度上可以治疗抑郁症、焦虑症、睡眠障碍、神经性头痛等疾病，但需要在医生指导下进行治疗，避免造成不良后果。

1、抑郁症：经颅磁刺激可以调节大脑神经递质，改善神经递质功能，进而可以治疗抑郁症。除此以外，经颅磁刺激还可以缓解抑郁症患者出现的情绪低落、兴趣下降、精力减退、失眠等症状;

2、焦虑症：经颅磁刺激可以调节5-羟色胺、去甲肾上腺素等神经递质的释放，在一定程度上可以治疗焦虑症。除了治疗焦虑症以外，也可以缓解失眠、情绪低落、心慌、胸闷等症状;

3、睡眠障碍：经颅磁刺激可以调节大脑神经递质，进而可以治疗失眠。除了治疗失眠以外，还可以缓解患者的早醒、多梦等症状;

4、神经性头痛：经颅磁刺激可以抑制中枢神经系统的兴奋性神经递质，进而缓解神经性头痛。除了治疗头痛以外，还可以缓解急性的脑血管痉挛，治疗脑供血不足等症状。

除上述疾病以外，经颅磁刺激还可以缓解慢性脑供血不足、脱髓鞘疾病等，如慢性脑供血不足患者出现的头痛、头昏、记忆力减退、眼花耳鸣等症状，以及脱髓鞘疾病造成的认知功能障碍，也可以通过经颅磁刺激治疗。

经颅磁刺激治疗颈椎病、肩周炎等疾病时，可以遵医嘱配合其他治疗，如超短波治疗、微波治疗，可以促进局部血液循环，进而改善症状。但如果患者身体较差，不能耐受强烈刺激，则不建议进行经颅磁刺激治疗，以免出现不良反应。