巧克力囊肿属于子宫内膜异位症的一种，有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢内生长，随着月经周期而出血，形成存在陈旧性积血的囊肿。临床上没有预防巧克力囊肿的措施，但可以通过避免诱发因素、调整饮食、注意个人卫生、预防疾病等方式降低发病几率。

1、避免诱发因素：巧克力囊肿可能是由于经期同房、人工流产、上环等原因，引起子宫内膜异位而导致的，所以经期女性应尽量避免经期同房，人工流产女性在进行手术后也要预防此疾病;

2、调整饮食：长期暴饮暴食、不规律饮食，或者过多食用辛辣刺激、寒凉食物等，都可能会对身体造成刺激，诱发巧克力囊肿。建议在日常生活中保持清淡饮食，可以适当增加新鲜水果蔬菜的摄入量，也要适当增加含蛋白质丰富的食物，比如奶类、蛋类、鱼类等;

3、注意个人卫生：由于女性生理结构的特殊性，尿道口、肛门离阴道口较近，如果不注意个人卫生，就可能导致细菌逆行感染，引起巧克力囊肿。建议日常要注意会阴部卫生，定期清洗私处，及时更换内裤，保持会阴部的清洁、干燥;

4、预防疾病：如果身体患有疾病，应及时治疗。比如子宫腺肌病引起的巧克力囊肿，可以遵医嘱应用布洛芬缓释胶囊等药物进行治疗;

5、其他：对于没有生育需求的女性，尽量在同房时做好避孕措施，以免意外妊娠而进行人工流产。人工流产次数过多也可能会引起巧克力囊肿，所以尽量避免做人工流产手术。