一般不能接受肠镜检查的疾病包括肠梗阻、肠穿孔、严重消化道出血，以及妊娠期女性。此外，对于存在肛周疾病者，通常也不建议做肠镜检查。

1、肠梗阻：由于肠内容物无法正常通过肠道，此时若进行肠镜检查可能会刺激肠道，导致肠道出现痉挛，加重疼痛症状，所以对于肠梗阻患者，一般不能接受肠镜检查;

2、肠穿孔：若存在肠穿孔的情况，由于局部存在创口，而进行肠镜检查时会接触到创口，加重疼痛且会影响病情恢复，因此也不能接受肠镜检查;

3、严重消化道出血：此时由于患者的凝血功能存在异常，进行肠镜检查时可能会引起大出血的情况，严重时甚至可能威胁生命安全，所以不能接受肠镜检查;

4、妊娠期女性：由于妊娠期女性体内的凝血功能可能会存在异常，且肠道比较脆弱，此时进行肠镜检查可能会出现出血的情况，不利于胎儿和自身的健康，所以通常也不能接受肠镜检查;

5、其他疾病：如巨结肠、穿孔性大肠炎等疾病患者，由于局部病变较为严重，且可能会影响胎儿和自身的健康，所以通常不能接受肠镜检查。

除上述情况外，对于存在心肺功能不全或严重精神疾病者，通常也不能接受肠镜检查。由于进行肠镜检查时可能会刺激机体的神经中枢，进而导致血压升高，加重心脏负担，所以存在以上疾病的患者在医生建议下不建议进行肠镜检查。