肚脐痛大便颜色发黑，可能是饮食因素引起，也有可能是胃肠功能紊乱、上消化道出血等疾病导致。若长时间难以缓解，建议及时到医院就诊，并遵医嘱进行处理。

1、饮食因素：如果近期服用铁剂等药物，或者是进食猪血、鸭血、猪肝等食物，可能会引起大便颜色发黑，也可能会出现肚脐周围疼痛的症状。但此类情况较少见，一般不需要特殊处理，停止吃相关食物后症状即可缓解;

2、胃肠功能紊乱：病因并不明确，可能与遗传、饮食、精神心理障碍等因素有关，可能会导致上腹部疼痛，并且会伴有腹泻、便秘等情况，严重时会引起出血，导致肚脐痛大便颜色发黑。可以遵医嘱服用多潘立酮片、枸橼酸莫沙必利片等药物，能够促进胃肠道蠕动;

3、上消化道出血：上消化道出血可能由消化性溃疡、食管胃底静脉曲张破裂等原因引起，上消化道出血会导致呕血、黑便等症状，从而出现肚脐痛大便颜色发黑的情况。需要及时通过手术、介入等方法进行治疗;

4、其他原因：如果患有结肠炎、直肠炎等疾病，炎症刺激肠道黏膜造成损伤时，可能会导致出血，并且会伴有腹痛、腹泻等症状，从而导致肚脐痛大便颜色发黑。此类患者可遵医嘱应用奥美拉唑肠溶胶囊、醋酸泼尼松片等药物进行治疗。