巨结肠手术在早期会出现吻合口瘘、吻合口狭窄、吻合口出血、吻合口感染等后遗症，而在晚期通常会出现肛门皮肤脱垂、吻合口狭窄、吻合口瘘等后遗症。

一、早期：

1、吻合口瘘：由于患者的特殊情况，在进行巨结肠手术时需要将远端结肠病变的肠段切除，再进行手工缝合，在操作过程中有可能会导致吻合口瘘，引起肠液大量外漏，出现剧烈腹痛、感染性休克等严重症状;

2、吻合口狭窄：患者进行巨结肠手术后，远端结肠的肠段仍然存在，如果出现炎症或水肿，会导致吻合口狭窄，患者可出现排便困难的情况;

3、吻合口出血：巨结肠手术过程中如果未合理止血，或术后进行剧烈运动，有可能导致吻合口出血，引起失血性休克等严重症状;

4、吻合口瘘：如果患者腹腔内出现严重感染，或吻合口处出现肿瘤，容易导致吻合口瘘，甚至需要进行二次手术治疗。

二、晚期：

1、肛门皮肤脱垂：患者由于肛门括约肌明显松弛，巨结肠手术后容易引起肛门皮肤脱垂，可经常用手还纳直肠;

2、吻合口狭窄：晚期严重的患者进行巨结肠手术后，容易造成吻合口狭窄，狭窄程度加重可能会导致肠内容物通过障碍，出现腹痛、腹胀，甚至肠梗阻等症状;

3、吻合口瘘：如果患者腹腔内的感染未得到控制，或吻合口周围组织炎症反应比较严重，容易导致吻合口瘘，引起腹腔感染性休克等严重情况。

除上述常见后遗症外，巨结肠手术还可能会导致吻合口狭窄、吻合口瘘等情况，建议患者术后遵医嘱进行护理，注意保持大便通畅，定时排便，避免便秘，以免对吻合口造成刺激。