对于脑炎后遗症的治疗，主要是针对患者出现的神经功能缺损，进行康复治疗，同时针对脑炎后遗症的并发症，进行对症治疗。

一、病因治疗：

脑炎后遗症通常是指脑炎在经过急性期的积极治疗后，一些患者仍留有不同程度的肢体运动障碍、感觉障碍、语言障碍、精神障碍等后遗症状，可能是由于脑炎引起脑组织损伤所致。

1、康复锻炼：如果是轻度脑炎，无肢体偏瘫等情况，可通过加强锻炼，尤其是肢体的功能锻炼，逐渐恢复;

2、药物治疗：脑炎后遗症患者通常需在医生指导下使用营养神经的药物，如维生素B1片、维生素B12片、甲钴胺片等进行治疗，有助于改善肢体运动障碍、感觉障碍等后遗症状。同时也可搭配使用胞磷胆碱钠胶囊、脑蛋白水解物片等营养脑细胞的药物进行治疗;

3、物理治疗：如果脑炎后遗症患者出现偏瘫等情况，建议进行理疗、按摩等物理治疗，促进肢体的血液循环，帮助患者恢复;

4、手术治疗：如果脑炎后遗症患者的后遗症状是脑积水引起，建议及时进行脑室分流等手术治疗，以缓解患者症状。

二、对症治疗：

1、康复锻炼：若脑炎后遗症患者出现偏瘫等运动功能障碍症状，建议在医生的指导下进行肢体按摩、低频电刺激、针灸等康复锻炼，以促进肢体功能的恢复;

2、药物治疗：脑炎后遗症患者出现癫痫症状时，建议遵医嘱使用丙戊酸钠缓释片、卡马西平片等抗癫痫药物进行治疗。同时若患者出现精神症状，可在医生指导下使用盐酸氟西汀胶囊、盐酸帕罗西汀片等抗抑郁药物进行治疗。