做了肛瘘手术后一般1-2周左右疼痛就会缓解或消失。但具体时间与患者病情、个人体质以及术后恢复情况有关。

一、轻度肛瘘

对于症状较轻的单纯性肛瘘，如低位单纯性肛瘘等，在进行肛瘘切除术时，由于切口较小且位置浅表，所以伤口愈合较快，通常在术后1周左右即可逐渐消退。

二、重度肛瘘

而对于复杂性的肛瘘，如高位复杂性肛瘘等，则需要行挂线疗法来治疗。此时创面较大，愈合速度相对较慢，可能需要2周左右的时间才能完全消除疼痛感。

三、其他因素

此外，部分患者的疼痛感可能会持续更长时间，这可能是由多种原因引起的，例如感染、血肿和水肿等并发症。因此，如果出现不适症状，请及时就医并接受专业医生的指导和治疗。

总之，肛瘘手术后的疼痛程度因人而异，并受到多种因素的影响。一般来说，随着伤口的愈合和身体的康复，疼痛会逐渐减轻直至消失。但如果疼痛持续不减或者加重，建议及时咨询专业的医生以获取正确的诊断和治疗方案。