肛门指检里面有软软的肉堵着可能是痔疮、直肠息肉、尖锐湿疣等疾病导致。建议患者及时去医院就诊，在医生指导下进行治疗。

一、生理因素

1.痔疮：由于长期久坐或饮食不当等因素可能会诱发痔疮，从而出现上述症状。如果没有其他不适的症状，一般不需要特殊处理，平时注意保持大便通畅即可。

二、病理因素

1.直肠息肉：如果存在肠道炎症或者遗传等情况，会导致直肠黏膜表面发生隆起性病变，从而出现上述情况。可以遵医嘱通过手术切除的方式进行治疗，比如内镜下黏膜剥离术、腹腔镜下直肠息肉摘除术等。

2.尖锐湿疣：通常是人乳头瘤病毒感染所引起的一种传染性疾病，会在肛周皮肤以及外生殖器部位生长赘生物，还会伴有瘙痒和疼痛等症状。可遵医嘱使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物缓解，必要时也可以采取液氮冷冻、激光等方式治疗。

除此之外，还可能与肛裂、肛瘘等原因有关，也会出现这种情况。如果伴随其他不适的症状，应及时到医院就医并进行相关检查，明确病因后在医生的指导下进行针对性治疗。