南京胃肠医院选择上，可以考虑南京鼓楼医院、南京军区南京总医院、南京同仁医院、南京医科大学附属南京医院、南京肛泰医院等。

1.南京鼓楼医院

南京鼓楼医院是南京市的一所大型综合医院，拥有先进的医疗设备和专业的胃肠科医生。该医院的胃肠科在国内享有较高的声誉，其专业领域包括胃肠道疾病诊断与治疗、内镜技术等。选择该医院可以得到高质量的医疗服务。

2.南京军区南京总医院

南京军区南京总医院是一所集医疗、教学、科研于一体的三级甲等综合性医院，设有胃肠外科。该医院的胃肠外科擅长各类消化道疾病的诊治，如胃肠肿瘤、炎症性肠病等。选择该医院可获得规范化的诊疗服务。

3.南京同仁医院

南京同仁医院是一家以消化内科为重点科室的大型医疗机构，设有胃肠病门诊。该医院的胃肠病门诊专注于慢性腹泻、便秘等常见消化系统疾病的诊治，具有丰富的临床经验。选择该医院能够获得专业的诊疗建议。

4.南京医科大学附属南京医院

南京医科大学附属南京医院是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合医院，设有消化内科。该医院的消化内科在胃肠功能紊乱、肝胆胰腺疾病等方面积累了丰富的经验，患者在此能得到全面的检查和治疗方案。

5.南京肛泰医院

南京肛泰医院是一家专注于肛肠疾病诊治的专科医院，同时也提供胃肠科相关服务。该医院注重中西医结合，在结直肠息肉、溃疡性结肠炎等疾病的管理方面有独到之处。选择该医院可以获得针对具体问题的个性化咨询。

在选择胃肠医院时，应考虑医院的专业水平及服务质量，同时关注自身症状变化，及时就医并进行针对性检查。