小便时尿痛，可能是急性损伤、泌尿系统感染、泌尿系统结石、前列腺炎、前列腺增生等因素导致。若症状较严重时，建议就医检查治疗，避免延误病情。

1、急性损伤：如尿道受到过度挤压或受到外力打击，导致尿道局部受损出血，在排尿的过程当中，尿液对受损部位造成刺激，就会引起小便时尿痛，可能还伴有轻度出血以及肿胀;

2、泌尿系统感染：通常与卫生不良、不洁性生活、机体免疫力较低等因素有关，若尿道内存在感染时，会导致尿液当中存在炎性物质，会对尿道造成刺激，就会引起小便时尿痛，可能还伴有尿频、尿急，严重时可出现肉眼可见血尿;

3、泌尿系统结石：比如膀胱结石，当膀胱内存在结石时，会随着身体活动反复刺激膀胱，并使膀胱内的黏膜充血水肿，进而会引起小便时尿痛，可能还伴有排尿困难、尿急、尿频等症状，严重时可出现急迫性尿失禁;

4、前列腺炎：可能与久坐、长时间饮酒吸烟、过度手淫等因素有关，由于炎性物质刺激，会导致前列腺局部肿大，引起排尿疼痛、会阴部胀痛、小腹疼痛等症状，表现为小便时尿痛;

5、前列腺增生：当腺体逐渐增大后，会压迫尿道，导致膀胱内的尿液排出阻力增大，引起排尿疼痛、尿频等症状，表现为小便时尿痛。