慢性咽炎伴发会厌囊肿时，可以考虑服用咽炎片、蒲地蓝消炎口服液、复方甘草片、阿莫西林、头孢克肟等药物进行治疗。由于会厌囊肿通常需要专业医生评估是否需要手术治疗，因此建议患者及时就医以获得适当的治疗建议。

1.咽炎片

咽炎片适用于慢性咽炎、急性咽炎反复发作的患者。该药物具有清利咽喉的作用。服药期间饮食宜清淡，忌食辛辣、鱼腥食物。

2.蒲地蓝消炎口服液

蒲地蓝消炎口服液可用于改善咽部不适、异物感等不适症状。本品为中成药，主要由苦地丁、板蓝根、黄芩苷等组成，具有抗病毒和抑菌的作用。服用时应避免与其他滋补性中药同时服用。

3.复方甘草片

复方甘草片对于咳嗽痰多的咽炎、会厌囊肿有较好的止咳效果。此药能直接抑制咳嗽中枢而产生镇咳作用。妊娠期及哺乳期妇女慎用。

4.阿莫西林

阿莫西林可治疗细菌感染引起的咽炎、会厌囊肿。其通过抑制细胞壁合成而发挥杀菌作用。溶血性链球菌感染患者用该药需加用盐酸巴氨西林。

5.头孢克肟

头孢克肟针对敏感菌所致的咽炎、会厌囊肿有效。其属于第三代头孢菌素类抗生素，能够干扰细菌细胞壁的合成，从而达到抗菌的目的。使用时应注意可能出现皮疹、瘙痒等症状，应及时停药并就医处理。

以上提及的所有药物均需要遵医嘱合理使用。慢性咽炎患者平时要保持口腔清洁卫生，饭后及时漱口，还要定期到医院复查，了解病情恢复情况。