食管功能性障碍不会直接引起呼吸困难，但严重时可能导致吸入性肺炎或窒息，从而引起呼吸困难。

食管功能性障碍主要是由于食管平滑肌的功能紊乱所致，此时食管下括约肌张力降低，而上括约肌则过度收缩，使食物无法顺利通过食管进入胃部，造成吞咽困难、反流等不适症状。若不及时处理，长期存在

上述不适症状会导致呛咳反射减弱，易发生误吸，当食物或其他物质被误吸入气道时，会堵塞呼吸道，引起呼吸困难。

如果患者存在贲门失弛缓症、弥漫性食管痉挛等情况，可能会导致贲门狭窄或者食管运动功能失调，进而引发吞咽困难、胸骨后疼痛等症状，并且可能伴随有不同程度的呼吸困难。

在治疗食管功能性障碍期间，应避免食用辛辣刺激性食物，以免加重胃肠道负担，不利于病情恢复。