脚踝骨折三个月后仍有肿胀和疼痛可能是感染、创伤性关节炎等并发症引起的异常表现。

骨折后机体免疫系统会受到刺激，易发生感染，此时会出现红肿热痛等症状；而骨折部位未完全恢复时，容易诱发创伤性关节炎，使关节活动受限，并伴有肿胀、疼痛的症状。这些并发症都属于非正常现象，需要及时就医诊治。

此外，如果患者在康复过程中再次受伤或摔倒，可能导致旧伤复发或者出现新的损伤，进而引起肿胀和疼痛。

这可能是因为骨折愈合不全或软组织损伤未得到充分修复。

因此，在骨折后的恢复期间，应密切关注肿胀和疼痛的变化情况，避免剧烈运动，以免加重症状。若肿胀持续存在且无法通过简单措施缓解，应及时复诊以排除潜在的并发情况。