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广州中医药大学第三附属医院由广州中医药大学附属骨伤科医院和芳村中医医院组成，是以中西医结合骨伤科为主体，兼具中医内、外、妇、儿、针灸理疗等相关配套专科的，具有鲜明中医药特色的，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的现代化中西医结合医院。广州中医药大学第三临床医学院与第三附属医院实行院院合一的管理体制，是广州中医药大学重要的医疗、教学、科研基地。广州中医药研究院骨伤科研究所亦落户我院。
广州中医药大学第三附属医院(第三临床医学院)的院训是“传承创新，和谐发展”。医院始终坚持以病人为中心的服务宗旨，以高超的技术促进发展，以科学的管理开拓创新，以优质的服务赢得声誉。全院人员求真务实、精益求精、医德高尚，竭诚为广大患者提供一流的医疗保健服务。我院始终致力于中医药优秀人才的培养，拥有一批以刘庆思教授为代表的在国内外相关领域享负盛名的医学专家。医院现有职工约844人，现有病床数617张，广东省名老中医1人，国家“优秀中医临床人才”1人，“千百十工程”校级培养对象共4人(第三批1人，第五批1人，第六批2人)，南粤优秀教师1人，博士生导师4人，硕士生导师29人，高级职称109名。具有研究生学历96名(硕士70名，博士26名)。第三临床医学院从1995年开始招收硕士研究生，1998年开始招收博士研究生，2002年开展博士后科研流动站工作，2005年开始招收本科生。迄今学院已培养毕业各类学生670人(学士489人、硕士128人、博士51人、博士后2人);目前在校生达704人(其中本科生618人、各类研究生86人)。
广州中医药大学第三临床医学院成立于2005年，同年招收中医学(骨伤科方向)本科生。学院现有中医学专业(骨伤科学方向)学士学位授权学科专业1个;硕士学位授权学科专业11个：中医骨伤科学、中医内科学、中医妇科学、中医儿科学、中药学、社会医学与卫生事业管理、内科学、妇产科学;博士学位授权学科专业3个：中医骨伤科学、中医内科学、针灸推拿学;可招收中医骨伤科学和针灸推拿学的博士后进中医学博士后科研流动站。经过“十一五”建设，学院各项教学工作已基本走上稳步健康发展的轨道。
建院三十余年来，经过医院全体员工的不懈努力，医院形成了鲜明的医疗优势和特色，医疗实力雄厚。骨伤科医院(广州中医药大学骨伤科研究所)是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的、以骨伤科为主的省级专科医院，是国内中医院校唯一的大学附属骨伤科专科医院，是广州中医药大学硕、博士培养点、优秀博士后流动站，是广东省公益二类事业单位、省市公伤定点医疗机构、广州市首批医保定点医疗机构。
骨伤科医院设有骨伤科、内科、妇科、针灸推拿科、急诊等一级临床科室和其他业务科室，下设关节骨科、创伤骨科、脊柱骨科、骨质疏松病、老年骨科、风湿病专科、血液肿瘤专科、心脑血管专科、呼吸专科等各类专科专病门诊10多个，开放病床140张。住院部设关节骨科、创伤骨科、脊柱骨科、骨质疏松病和老年骨科四个专科病区，运用中西医治疗手段诊治各种骨折、关节脱位、股骨头坏死、骨质疏松症、骨关节病、腰椎间盘突出症、腰椎滑脱、颈椎病、各种痛症及软组织损伤等疾患。医院坚持把突出中医特色贯彻到临床治疗的每一个环节，先后研制出10多个骨伤科中药复方制剂，其中十味骨康口服液、温通膏、龙虎膏治疗跌打损伤，具有独到的临床疗效，蜚声省内外。
骨伤科医院始终瞄准中医骨伤科学发展前沿，秉承中医中药特色，不断突破自我，我院中医骨伤科是国家中医药管理局“十一五”重点专科建设项目，是国家“十一五”重点专科重点病种“骨质疏松症”全国协作组组长单位，突出专科特色，加强名院、名科、名医、名药(本院制剂)建设。2011年7月我院顺利通过国家中医药管理局专家组对我院骨伤科进行的国家“十一五”重点专科(专病)建设项目评审验收。我院关节病科等7个专科成为广东省“十二五”中医重点(特色)专科建设项目。
芳村分院是一所技术力量雄厚的综合性中医医院，是广州市医保定点医疗机构。
芳村分院设有内科、外科、骨伤科、妇科、儿科、急诊科、针灸推拿科、口腔科、眼科、耳鼻喉科、皮肤科等临床科室，下设心血管专科、呼吸专科、消化专科、乙肝专科、糖尿病专科、冠心病专科、高血压专科、中风专科、中医杂病专科、乳腺专科、肛肠专科、泌尿外科、碎石专科等，并配有药剂科、放射科、检验科、B超室、心电图及动态心电图室、脑电图室、内窥镜室、阴道镜室等临床医技科室。医院设有内科综合病区、骨外科病区，开放床位110张。大学城校区门诊部负责我校大学城校区学生和教职工的门急诊诊疗、免疫及健康体检工作。
医院积极探索在新形势下的中医院发展道路，医院规模逐年扩大，医疗水平日益提高。广州中医药大学第三附属医院(广东省中西医结合骨伤科医院)新院2015年1月已投入使用，该院位于荔湾区龙溪大道花地河以西，芳村体育中心以东地段，与佛山市南海区接壤。总用地面积62332平方米，规划建筑面积9.8万平方米，设置病床数1200张。一期设置病床400张，目前已开放病床350张。
一期门诊住院楼设置急诊科、创伤骨科、脊柱科、关节科、运动医学科、康复科、骨质疏松科、针灸推拿科、血液肿瘤科、颅脑外科、胸外科、普外科、泌尿外科、妇科、儿科、口腔科、麻醉科等临床科室。设置影像科、检验科、药剂科、B超室、心电图室等医技科室。麻醉科有12间手术室，百级3间，万级9间。
医院配备各类先进和现代化的医疗设备，主要有1.5T磁共振成像设备、64排128层CT机、多功能数字X线摄影系统(DR)、彩超仪、骨密度仪、关节镜手术设备、腹腔镜、宫腔镜、Leep刀、生化免疫流水线、全自动细菌药敏鉴定仪等。
2015年10月26日至27日，国家中医药管理局专家组对医院进行了国家三级中医骨伤医院等级评审，评审内容包含资料审核、现场访谈、实地检查。经过两天严格的检查，该院顺利完成三甲评审。经国家中医药管理局审核同意，确定该院为三级甲等中医专科医院，有效期从2015年12月9日始至2019年12月8日止。
医院始终瞄准中医骨伤科学发展前沿，秉承中医中药特色，不断突破自我，2002年医院骨伤学科成为广州中医药大学国家级和省级重点学科“中医骨伤科学”的重要组成部分。2005年1月医院“骨质疏松病专病医疗中心”顺利通过了广东省中医药局组织的专家组验收。2007年10月医院骨伤专科被确认为国家中医药管理局“十一五” 重点专科(专病)建设项目、重点病种“骨质疏松症” 全国协作组组长单位，2008年医院“骨质疏松病科”被广东省卫生厅、广东省中医药局确定为广东省首批中医名科。骨伤科的发展带动了全院各科的发展，内科、针灸推拿科、妇科等科室中医特色优势明显。内科血液肿瘤专科是医院重点建设和发展的科室，综合实力强，擅长解决血液病诊治中的疑难问题。在省政府的高度重视，省卫生厅、省中医药局的殷切关怀和大学的大力支持下，2007年医院成功申办了广东省中西医结合骨伤科医院项目，并被列入了《广东省中医药发展 “十一五”规划》重大项目。
广州中医药大学硕、博士培养点、博士后流动站，是广东省公益二类事业单位、省市公伤定点医疗机构、广州市首批医保定点医疗机构。
医院配置了CT、DR、彩色B超、全自动生化分析仪、关节镜、椎间盘镜、骨密度、重症监护系统和先进手术设备等医疗设备。
