慢性肠胃炎的治疗可能需要使用双歧杆菌、乳酸菌素、枯草杆菌等益生菌制剂来改善肠道菌群平衡，或通过口服山莨菪碱、阿托品缓解症状。但慢性肠胃炎的治疗需个体化，建议在医生指导下使用药物，避免自行滥用药物造成不良后果。

1.双歧杆菌

双歧杆菌适用于肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀。该药物能够抑制有害细菌的生长，促进有益菌繁殖，恢复肠道微生态平衡。

服用时应摇匀，且不宜与抗菌药同时使用。

2.乳酸菌素

乳酸菌素对于消化不良、肠功能紊乱等引起的腹痛、腹泻有治疗效果。本品能促进胃液分泌，增强食欲和消化功能。哺乳期妇女及糖尿病患者应在医师指导下使用。

3.枯草杆菌

枯草杆菌适用于小儿腹泻病。本品可直接补充正常生理性活菌，调整肠道菌群，抑制肠道内有害细菌过度繁殖，抑制肠毒素的产生和肠粘膜炎症反应。对本品过敏者禁用。

4.山莨菪碱

山莨菪碱用于解除平滑肌痉挛，胃肠绞痛。本品具有阻断节后胆碱受体，对抗乙酰胆碱的作用。新生儿、青光眼慎用。

5.阿托品

阿托品用于有机磷中毒解救。本品能通过与有机磷酸酯类竞争性地与胆碱酯酶结合，从而阻止了有机磷酸酯类与胆碱酯酶的结合，使被抑制的胆碱酯酶复活。早产儿、婴幼儿慎用；新生儿禁用。

针对慢性肠胃炎的治疗，患者可在医生指导下使用抗生素如诺氟沙星进行抗感染治疗。患者平时应注意饮食卫生，避免食用辛辣刺激性食物，保持规律作息，以利于病情恢复。