大便时肛门持续疼痛可以考虑采取中药调理、坐浴、肛门括约肌松弛剂、镇痛药物、激光治疗等方法进行治疗。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医以确定具体原因并接受适当治疗。

1.中药调理

通过内服外敷的方式，如使用马应龙麝香痔疮膏、红霉素软膏等局部涂抹，具有消肿止痛的作用。

适用于轻度至中度的肛门疼痛，患者对疼痛耐受性较低的情况。

2.坐浴

利用温水或添加了特定草药的溶液进行肛门部位的浸泡，例如使用高锰酸钾溶液或者花椒水进行熏洗，可以起到促进局部血液循环的效果。对于缓解排便后短暂的不适感有帮助，但不宜频繁使用。

3.肛门括约肌松弛剂

通过口服或注射给药，如盐酸阿扑吗啡贴片、利多卡因凝胶等，可减少肛门括约肌紧张，从而减轻疼痛。具体用药需遵医嘱。主要用于缓解肛门括约肌痉挛引起的疼痛，如肛裂、痔疮等。

4.镇痛药物

通过口服或直肠给予非处方止痛药，如布洛芬缓释胶囊、对乙酰氨基酚片等，能减轻炎症和缓解疼痛。适合短期缓解手术后或其他原因导致的肛门疼痛，长期使用需谨慎，并遵循医生指导。

5.激光治疗

利用特定波长的激光直接作用于受损区域，如CO2点阵激光器、Er:YAG激光器等，能够精确地去除异常组织，达到止痛的目的。主要针对由血栓性外痔、肛周脓肿等疾病引起的持续性肛门疼痛。

在治疗持续性肛门疼痛的过程中，建议调整饮食结构，增加膳食纤维摄入量以改善便秘情况，避免食用辛辣刺激性食物。同时保持肛周清洁干燥，避免久坐硬座，适当做提肛运动也有助于缓解症状。