小脑扁桃体下疝伴脊髓空洞症通常是先天性的。

小脑扁桃体下疝伴脊髓空洞症是因为胚胎时期原始脑干发育不全、中线结构发育异常所致。这种疾病常伴有其他神经管缺陷，如小脑蚓部缺损等，这些都属于先天性畸形范畴。

在某些情况下，后天因素也可能导致小脑扁桃体下疝或脊髓损伤，进而引发类似症

状。例如严重的外伤可能导致颈髓受损，但这种情况相对较少见。

虽然大部分的小脑扁桃体下疝伴脊髓空洞症为先天性疾病，但也有少数是由后天因素引起的。因此，在诊断时应仔细区分以制定合适的治疗方案。