做完肛瘘手术胃不舒服可能是术后镇痛药物的影响。

术后镇痛药物如阿片类药物可抑制中枢神经系统，进而降低胃肠蠕动，导致胃排空延迟。这使得食物在胃中停留时间延长，产生不适感。同时，全身麻醉也可能暂时影响胃肠动力，加剧不适症状。建议咨询医生调整镇痛方案或给予促进胃肠运动的药物以缓解症状。

如果患者还伴有恶心、呕吐等症状，则可能与术后肠麻痹有关。此外，若疼痛剧烈且持续不缓解，需警惕是否存在并发感染或其他并发症的发生。

术后恢复期间应遵循医嘱调整饮食结构，并注意休息，避免剧烈运动，以免加重不适症状。