长期喝碧生源可能会导致不孕不育，但不孕不育多由多囊卵巢综合征、输卵管堵塞、子宫内膜异位症等原因导致，而非常少见的情况是喝了很多碧生源的饮料，可能会引起女性出现月经紊乱，但一般不会导致不孕不育。

1、多囊卵巢综合征：多囊卵巢综合征病因尚不明确，可能与遗传、环境等因素有关，主要表现为月经失调、痤疮、多毛等，有些女性还会出现闭经，甚至不孕不育的现象。多囊卵巢综合征的女性体内激素水平长期紊乱，会对卵巢排卵造成影响，如果卵泡不能正常发育、成熟，长期饮用碧生源，可能会导致不孕不育;

2、输卵管堵塞：输卵管堵塞多由感染、损伤、炎症等因素引起，输卵管堵塞会影响精子卵子结合，从而导致女性不孕不育。而碧生源主要含有一些添加剂，在一定程度上可能会影响输卵管的蠕动，所以有输卵管堵塞的女性在喝了碧生源之后可能会加重输卵管堵塞的情况，从而导致不孕不育;

3、子宫内膜异位症：子宫内膜异位症病因尚不明确，可能与遗传、环境等因素有关，主要表现为痛经、月经异常、不孕不育等。而碧生源中含有一些添加剂，可能影响子宫内膜的正常剥脱，如果子宫内膜异位症的女性同时患有子宫肌瘤等疾病，则可能影响精子剥脱，从而可能导致女性出现不孕不育;

4、月经紊乱：部分女性可能由于过度节食减肥等因素导致月经紊乱，此时身体内分泌水平失衡，可能会引起卵巢功能异常，进而导致女性出现不孕不育的情况。