女性凌晨突然尿频尿痛可能是由泌尿系统感染引起的。

泌尿系统感染是由病原体如细菌入侵泌尿系统所引起的炎症反应，通常会出现尿频、尿急、尿痛等典型症状。夜晚人体新陈代谢减慢，免疫功能下降，此时发生感染容易导致上述不适症状加重，从而出现凌晨突然尿频尿痛的情况。

如果患者存在膀胱炎、尿道炎等疾病时，在夜间由于迷走神经兴奋性增高，会导致膀胱逼尿肌收缩力增强，进而引起尿频、尿痛的症状。此外，还可能伴随尿液浑浊或发热等症状。

针对这种情况，建议患者及时就医进行尿常规检查以及尿培养以确定是否存在感染，并接受相应治疗。同时还要注意多喝水，促进排尿，但不要憋尿，以免加重病情。