男性衣原体感染一般不能自愈。

衣原体感染是一种由衣原体引起的传染病，具有一定的传染性，如果不及时治疗，可能会引起尿道炎、前列腺炎等疾病的发生，严重时甚至会导致不育。因此，男性衣原体感染需要积极进行药物治疗，如遵医嘱使用多西环素片、盐酸米诺环素胶囊等抗生素类药物控制病情发展。

个别患者在免疫力较强的情况下，轻度感染且无并发症者可能有自愈的可能性。

面对衣原体感染，应避免过度焦虑，保持良好的个人卫生习惯，同时关注自身症状变化，定期复查以监测病情进展。