衣原体感染扁桃体炎会引起局部炎症反应，炎症因子刺激扁桃体，导致其反复充血肿胀。

衣原体感染引起扁桃体炎后，炎症会刺激扁桃体黏膜，使其出现红、肿、热、痛等典型表现。当机体免疫力下降时，炎症无法得到及时控制，从而导致扁桃体炎反复发作。

此外，患者还可能会有吞咽困难、发热等症状。这些症状可能与免疫系统的过度反应有关。

针对衣原体感染引起的扁桃体炎，治疗通常需遵医嘱采用抗生素治疗，如多西环素或阿奇霉素。患者应保持充足的休息，避免辛辣食物，并确保充足的水分摄入以促进愈合。