入睡困难、大便次数多，可能是消化不良、肠易激综合征、慢性肠炎、甲状腺功能亢进症等多种疾病引起。若症状持续存在，建议及时前往医院的消化内科就诊，明确病因。

1、消化不良：患者睡前暴饮暴食，或摄入过多难以消化的食物，导致食物堆积在胃肠道，难以被消化吸收，出现消化不良的情况，从而可引起入睡困难、大便次数多的症状。通常可在医生指导下服用健胃消食片、乳酸菌素片等药物进行治疗;

2、肠易激综合征：可能是患者长期精神紧张、压力过大等原因引起，夜间神经兴奋，导致胃肠道功能亢进，从而引起入睡困难、大便次数多的症状。通常可在医生指导下服用地衣芽孢杆菌活菌胶囊、马来酸曲美布汀片等药物进行治疗;

3、慢性肠炎：患者因食用被污染的食物，致使病原体入侵肠道引起感染。炎症可刺激肠道黏膜，导致肠道蠕动过快，使患者出现频繁腹泻的症状，从而造成入睡困难、大便次数多。通常可在医生指导下服用美沙拉秦缓释颗粒、肠炎宁片等药物进行治疗;

4、甲状腺功能亢进症：由于患者体内甲状腺激素分泌过多，导致机体基础代谢率提高，神经兴奋性增加，从而导致患者睡眠困难。而若患者本身患有甲状腺功能亢进症，即可导致大便次数多的情况。通常可在医生指导下服用甲巯咪唑片、丙硫氧嘧啶片等药物进行治疗。

除此之外，若是存在肠道肿瘤，当肿瘤增大时，会导致胃肠道功能亢进，从而引起排便频繁。而在晚上时，注意力比较集中，就可能会导致入睡困难。所以建议及时前往医院就诊治疗，以免耽误病情。