眼部扁平疣通常是疾病自愈的表现，如果不能自愈，患者可以通过外用药物、口服药物等治疗，也可进行激光治疗。扁平疣是由人乳头瘤病毒感染引起的感染性疾病，通常发生于上眼睑、脸颊、额部等暴露部位，常通过直接接触传播。

1、外用药物：患者可以外用维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等药物，此类药物具有一定腐蚀性，可以使疣体细胞发生坏死，从而达到治疗效果。患者也可以外用干扰素α-2b软膏，此类药物可以直接注射入疣体损害部位，但通常不建议单独使用;

2、口服药物：如果患者眼部的扁平疣较多、较大，可以遵医嘱口服免疫调节药物，如转移因子胶囊、胸腺肽肠溶片等，上述药物可以提高机体对病毒感染的免疫力，从而促进疾病恢复。如果患者存在某些免疫功能低下的疾病，如糖尿病、器官移植等，可以遵医嘱服用调节免疫力的药物，如左旋咪唑片等;

3、激光治疗：如果患者使用药物治疗效果不佳，可以进行激光治疗，激光可破坏疣体，达到治疗效果。目前常用的激光是二氧化碳激光，将疣体破坏后，局部可以外涂夫西地酸乳膏等消炎药物，避免发生感染;

4、其他治疗：如果患者眼部扁平疣数量较多，可以分批、分次治疗，也可以进行自体疣免疫疗法。为防止复发，可在医生的指导下，局部外涂水杨酸软膏等角质剥脱剂，或使用干扰素注射液等。

眼部扁平疣通常是由人乳头瘤病毒感染引起，发生在眼部的扁平疣较为常见，多发生于面部，尤其是眼睑部位。患者在发病期间需要注意休息，避免过度劳累、过度熬夜，同时避免长时间日晒等，以免影响疾病恢复。