习惯性流产的鉴别诊断主要包括免疫功能异常、染色体异常，以及感染性疾病等。建议患者及时前往医院就诊，在医生指导下进行针对性治疗。

一、免疫功能异常

1.自身免疫功能异常：如系统性红斑狼疮、干燥综合征等疾病，由于机体存在抗原抗体反应，导致胚胎发育受到影响而出现反复流产的情况；

2.同种免疫功能异常：如果孕妇体内有丈夫或他人淋巴细胞嵌入到胎盘中，则可引起胎儿被排斥而导致流产；

3.封闭抗体阴性：正常情况下母体血液中含有封闭抗体，可以防止胚胎组织被母体免疫系统攻击，但部分女性会出现封闭抗体阴性的现象，此时则会因为母体对胚胎组织产生免疫反应而发生流产。

二、染色体异常

若夫妻双方或一方存在染色体异常情况时，可能会导致胚胎染色体异常，从而影响胚胎生长发育，进而造成反复流产的现象；

三、感染性疾病

如果在怀孕期间受到细菌、病毒或其他病原微生物侵袭时，也有可能会导致宫腔内环境改变，使胚胎无法着床或者受精卵停止发育，进而表现为习惯性流产。

除上述原因外，甲状腺功能减退症也可导致习惯性流产的发生。因此，当出现习惯性流产后，需要积极查找病因，并根据具体情况进行相应处理。