克霉唑塞阴道后几天小便刺痛，有可能是正常的生理现象，也有可能是药物刺激、过敏或者阴道炎症加重引起。需要根据不同的原因进行处理，避免影响女性的健康。

1、生理现象：克霉唑阴道用药治疗期间，随着药物的吸收，阴道内残留的药物会逐渐排出体外。在排出这些药物的过程中，会对阴道壁造成刺激，部分女性就会出现小便刺痛的现象。但是这种情况一般比较轻微，持续一段时间能够自然缓解，不用过于担心;

2、药物刺激：克霉唑阴道用药期间，部分女性阴道壁会对药物出现反应，从而造成阴道壁充血、水肿等病变，也会引起小便刺痛的感觉。但是等异物排出后，小便刺痛的症状也可以自然缓解，不用过于担心;

3、过敏：使用克霉唑期间，部分女性可能会对克霉唑中的药物成分出现过敏，用药后就会发生过敏反应，从而造成阴道黏膜的刺激性疼痛、红肿等，部分女性也会出现小便刺痛的症状。但是等症状自然消失后，小便刺痛的症状也可以自然缓解;

4、阴道炎症加重：部分女性患有外阴阴道假丝酵母菌病后，随着病情发展，大量的白色念珠菌会对阴道壁造成损伤，还可引起阴道充血、水肿等。如果刚开始用药后就出现小便刺痛的现象，可能和药物刺激有关。建议及时到医院做分泌物常规检查，判断是否有问题。如果是外阴阴道假丝酵母菌病引起，可以遵医嘱使用克霉唑栓治疗。