怀孕40天习惯性流产，可能是胚胎因素、母体因素、父亲因素或环境因素等原因导致。如果出现这种情况，建议及时到医院就诊，在医生指导下进行针对性治疗。

一、原因

1.胚胎因素：如果胚胎染色体异常，则可能出现胚胎停育的情况；

2.母体因素：比如孕妇患有全身性疾病，如严重感染、高热等，或者存在内分泌疾病，如黄体功能不全、甲状腺功能减退症等，以及生殖器官畸形、子宫肌瘤、宫腔粘连等情况，都可能影响受精卵着床和发育，从而引起习惯性流产；

3.父亲因素：若男性精子质量差，也可能导致胎儿生长受限，甚至发生流产；

4.环境因素：如果在孕早期接触有毒有害物质，也可能会对胎儿造成不良影响，进而出现习惯性流产的现象。

二、治疗

对于胚胎染色体异常引起的习惯性流产，一般没有有效的治疗方法。如果是由于母体因素所导致的，可以在下次妊娠前进行相应的检查和处理，以提高再次妊娠的成功率。如果是由于父源性的染色体异常所致，需要在孕前咨询遗传学专家的意见，并采取适当的措施来降低风险。如果是由于母亲患有一些慢性病，应该积极治疗原发病，待病情稳定后再考虑妊娠。如果是由于生活环境不佳所致的习惯性流产，应尽量避免接触有害物质，保持良好的生活习惯和饮食习惯。

此外，还有一种情况是女性既往有自然流产史，此次又出现习惯性流产，此时要警惕是否为免疫系统疾病所致，可以做抗心磷脂抗体等相关检查明确诊断。