流产手术不能查出HPV，因为流产手术是对宫腔内的妊娠组织进行取出，并不会对宫颈口进行相关的检查。HPV是人乳头瘤病毒，如果在宫颈口进行手术，可能会造成宫颈的损伤，严重者可能会造成宫颈机能不全，甚至造成不孕。对于HPV的检查，主要是进行宫颈脱落物的检查，看是否有HPV感染。如果想检查是否有HPV感染，需要通过抽血化验，以及结合临床症状进行判断。

1、抽血化验：女性可以抽血检查血液中HPV的含量，如果血液中含有HPV，则提示可能存在HPV感染;

2、结合临床症状：女性在感染HPV病毒之后，通常会在宫颈口附近出现灰白色、菜花样的赘生物，也就是平时说的肉疣，这种情况要高度怀疑是否有HPV感染，再进一步做检查进行确诊。但此时的病变部位并不在宫颈口，而是出现在宫颈管或者是宫颈阴道部位，所以在进行检查时，此类女性可以取组织做病理检查，进一步判断是否存在HPV感染;

3、宫颈管搔刮术：如果高度怀疑女性存在HPV感染，还可以做宫颈管搔刮术，在搔刮术取出的活检组织要送病理检查，进一步判断是否存在宫颈病变;

4、宫颈活检：女性在怀孕期间不建议做宫颈活检，因为在怀孕期间如果取活检，可能会对宫颈造成一定的损伤，严重者甚至会引起流产。

因此，对于女性而言，做流产手术不能查出HPV。对于育龄期的女性来说，建议定期进行宫颈癌的筛查。