跑步小腹痛，可能是由于生理性因素引起，也有可能是病理性因素导致。如胃肠道痉挛、急性肠炎等疾病，建议及时到医院就诊，在医生指导下进行针对性治疗。

一、生理性因素

如果在跑步前没有做好热身运动，或跑完步后没有做拉伸动作，可能会使腹部肌肉受到牵拉而出现疼痛症状，一般不需要特殊处理，适当休息即可缓解。

二、病理性因素

1.胃肠道痉挛：若患者存在胃肠功能紊乱的情况，则可能导致胃肠道平滑肌发生痉挛性收缩，从而引发上述情况，并伴有恶心、呕吐等症状；

2.急性肠炎：多由细菌感染等因素所诱发，炎症刺激可造成肠道黏膜充血水肿，甚至糜烂坏死，严重时还会伴随发热、腹泻等情况。

除以上相对常见原因外，还有其他的可能性疾病，比如阑尾炎、胰腺炎等，需鉴别诊断。