肛门指检摸到不光滑也不疼可能是由于痔疮、直肠息肉等原因导致的。患者需要根据不同的原因采取相应的治疗措施。

1.痔疮：如果患者存在痔疮的情况，在进行肛门指检时可能会出现上述情况，并且还会伴随大便出血等症状。建议可以在医生指导下使用复方角菜酸酯乳膏等药物进行局部涂抹改善症状。必要时，则可以通过手术的方式进行切除治疗。

2.直肠息肉：如果患者的直肠部位出现了息肉，在进行肛门指检时也会出现上述现象，并且还伴有腹痛、腹泻等症状。对于体积较小的直肠息肉，可以遵医嘱通过内镜下黏膜剥离术等方式进行治疗。而对于体积较大的直肠息肉，则需要及时通过外科手术切除病灶的方式进行处理。

除此之外，也有可能是肛周脓肿、肛瘘等原因造成的，还需要及时就医诊断治疗。