用肉毒素治疗肛裂通常会有一定的副作用，可能会导致肛门括约肌受损，也可能会导致肉毒素过敏或者局部感染，还可能会影响内分泌，导致面部出现不良反应。建议患者在专业医生的指导下使用肉毒素，以免产生不良反应。

1、肛门括约肌受损：如果在使用肉毒素的时候操作不当，可能会导致肛门括约肌受损，引起肛门狭窄，从而影响到正常的排便，如果比较严重，还可能会导致出现肛门失禁的情况。

2、肉毒素过敏：肉毒素具有一定的毒性，如果本身属于过敏性体质，部分人在使用后可能会产生过敏反应，继而出现局部红肿、疼痛的症状。

3、局部感染：在使用肉毒素的时候，如果没有做好消毒工作，或者是没有严格按照医生的指导进行操作，可能会导致伤口部位感染，从而导致伤口部位出现肿胀、疼痛，部分人还可能会出现脓性分泌物。

4、影响内分泌：肉毒素具有一定的神经阻断作用，如果长时间使用，可能会影响到人体内分泌，导致内分泌失调，出现疲劳、胃口下降、精神状态不佳等症状。

平时在使用肉毒素的时候，需要注意掌握正确的方法，要根据医生的指导来合理的使用，避免产生不良反应。如果用肉毒素治疗肛裂后效果不明显，建议及时到医院肛肠外科就诊，完善视诊等检查，以明确具体原因。