一般可以通过B超检查、肿瘤标志物检查、腹腔镜检查、腹腔镜检查等方法，来判断卵巢囊肿。卵巢囊肿是指卵巢内或其表面形成的含有液体或固态物质的囊状结构，可分为生理性囊肿和病理性囊肿。

1、B超检查：B超可观察到卵巢的外观正常，并且两侧卵巢大小与子宫基本相似，表面光滑，侧壁略呈强回声。但是如果是病理性囊肿，在B超检查下可以看到卵巢表面出现不均匀的增强回声或中强回声，而且还会发现卵巢局部出现边界不清的情况;

2、肿瘤标志物检查：可以通过肿瘤标志物检查来判断卵巢囊肿是良性还是恶性，但是一般建议通过抽血检查妇科肿瘤三项来进行辅助判断，如果妇科肿瘤三项检查结果出现异常，则卵巢囊肿的可能性较大;

3、腹腔镜检查：可以通过腹腔镜检查来判断卵巢囊肿的位置，并且可以将卵巢囊肿取出做病理化验，但是腹腔镜检查费用较高，而且具有创伤性，可能会引起疼痛;

4、腹腔镜检查：通过腹腔镜检查可以观察到卵巢表面是否存在粘连，也可以将卵巢囊肿取出做病理检查，但是需要在麻醉下进行，所以痛苦性相对较大。

此外，CT检查和核磁共振检查也可以用来判断卵巢囊肿，但是一般不作为首选。由于卵巢囊肿有良性和恶性之分，如果是生理性囊肿，建议定期随访，不需要治疗。如果是病理性囊肿，可能会影响卵巢功能，甚至导致压迫症状，则需要通过手术进行治疗，建议根据自身情况在医生的指导下进行选择。