晚期鼻咽癌头疼、眼睛疼，可能是因为肿瘤转移、鼻咽炎、青光眼、颅内病变导致。建议患者及时前往医院耳鼻喉科就诊，进行血常规、视诊等检查，明确病因后对因治疗。

1、肿瘤转移：晚期鼻咽癌患者，其肿瘤细胞转移到头部、眼部等部位，产生压迫症状，会导致患者出现头疼、眼睛疼的症状。此时建议患者可以在医生指导下，使用盐酸麻黄碱滴鼻液等药物缓解症状，并及时通过手术切除癌变组织;

2、鼻咽炎：患者在晚期时，体内的免疫功能会逐渐下降，引起病毒感染，导致鼻咽部位受到刺激，引发鼻咽炎，使患者出现头疼、眼睛疼的症状，并伴有乏力、头昏等症状。患者可在医生指导下，使用人工牛黄甲硝唑胶囊、维生素B2片等药物缓解;

3、青光眼：患者在晚期时，房水外流阻力增大，而眼压升高会导致视神经损伤、视野缺损，引起青光眼。此时房水堵塞，会引起眼压升高，出现头疼、眼睛疼的症状。患者可在医生指导下使用降眼压药物，如布林佐胺滴眼液、毛果芸香碱滴眼液等;

4、颅内病变：如果患者本身患有鼻咽癌，随着病情发展，癌细胞侵犯到颅脑，导致颅内压增高，压迫到脑神经，从而导致患者出现头疼、眼睛疼的症状。建议患者及时前往医院通过手术切除局部病灶，防止病情加重。

患者在治疗期间应注意饮食清淡，多吃菠菜、苹果、白菜等食物，不要吃辛辣刺激性食物，以免不利于病情恢复。