刷牙很干净但是口臭很重，可能与饮食不当、口腔疾病、消化系统疾病等因素有关。建议及时就医，明确病因后进行针对性治疗。

1、饮食不当：如果进食大蒜、洋葱等味道较重的食物，或长期不刷牙导致食物残渣堆积在口腔内，可能会出现刷牙很干净但是口臭很重的情况。此时不需要特殊处理，可以通过多喝水、勤漱口等方式缓解症状；

2、口腔疾病：如牙龈炎、龋齿等，由于炎症刺激以及细菌感染等原因，可引起牙龈红肿、出血等症状，同时伴有口臭。患者需要遵医嘱使用甲硝唑片、阿莫西林胶囊等药物进行抗感染治疗。如果是龋齿引起的，则需要通过补牙的方式进行治疗；

3、消化系统疾病：如胃炎、胃溃疡等，由于幽门螺杆菌感染或者胃酸分泌过多等原因，可引起腹胀、反酸等症状，同时伴有口臭。患者可以遵医嘱服用奥美拉唑肠溶胶囊、雷贝拉唑钠肠溶胶囊等药物抑制胃酸分泌，改善不适症状。此外，如果存在肝胆疾病，如肝炎、胆囊炎等，由于肝脏功能受损或者胆汁淤积等原因，可引起食欲减退、恶心等症状，并且伴有口臭。患者可以在医生指导下服用复方甘草酸苷片、熊去氧胆酸片等药物进行治疗；

4、其他因素：如果患有鼻窦炎等疾病，由于鼻腔内分泌物增多堵塞鼻腔，可引起鼻塞症状，并且会导致呼吸不畅，从而引起张口呼吸的现象。此时口腔内的空气会与外界的空气发生交换，在空气中会产生大量的二氧化碳气体，从而引起上述现象。患者可以遵医嘱服用通窍鼻炎片、鼻渊通窍颗粒等药物进行治疗。