肛门指检两厘米有个肉球可能是痔疮、尖锐湿疣等疾病导致的。患者需要根据不同的病因选择合适的治疗方式。

1.痔疮：痔疮是一种常见的肛肠疾病，通常是由于直肠下端或者肛管部位静脉丛迂曲扩张所形成的柔软包块，通常会伴有疼痛、瘙痒等症状。如果病情比较严重，可能会出现上述症状。建议患者可以在医生指导下使用复方角菜酸酯乳膏、氢化可的松乳膏等药物进行局部涂抹缓解不适症状。必要时，也可以通过手术的方式进行治疗，如吻合器痔上黏膜环切术等。

2.尖锐湿疣：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的以肛门生殖器部位增生性损害为主要表现的性传播疾病。一般会出现丘疹、疣状皮损等情况，并且还可能会伴随异物感、灼痛或刺痒感等症状。可以遵医嘱外用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等药物进行治疗。同时还可以在医生指导下配合物理治疗，比如激光治疗、冷冻治疗等方式改善。

除此之外，也有可能是肛周脓肿等原因造成的，建议及时就医进行检查并治疗。