精子畸形率的检查步骤主要包括精液采集、显微镜观察和统计学分析等。

一、精液采集

1.准备：在进行精液采集前，需要禁欲3-7天，并且要避免吸烟、饮酒以及泡温泉等活动。同时，在采集过程中，还需要注意保持外阴清洁卫生，以免影响检查结果。

2.操作方法：将干净的容器放在患者的睾丸下方，然后用手指捏住患者两侧的输精管，挤压出精液，最后将收集到的精液放入干净的容器中保存。

二、显微镜观察

1.观察时间：一般情况下，建议等待5分钟至10分钟左右的时间再开始观察。

2.观察内容：首先，医生会使用高倍显微镜对精子进行观察，如果发现有头部异常、尾部卷曲或不完整的精子，则可以初步判断为畸形精子。

三、统计学分析

当出现上述情况时，患者还可以通过计算机软件来计算精子畸形率，从而得出准确的结果。

除此之外，还要结合其他检查项目来进行综合诊断。